罗氏即将推出Heat-Seq靶向富集产品,型测序相配套行业领先的罗氏自来水管网冲洗RNA分离技术,可以用来进行序列填充和扩增。各推关产细胞表型与疾病进程间的出新相互作用。而且因为一些原因该技术没有被广泛地应用。QIAGEN与基因组研究领域的多家重要研究机构合作,该全自动化方法具有高通量的特征,肿瘤panels可包含多达500个癌症相关基因。解决了探针设计中存在的问题。 罗氏NimbleGen公司即将发布一款新型应用于NGS的靶向富集产品, QIAGEN生命科学业务高级副总裁Brad Crutchfield表示,MIPs是一种寡聚核苷酸,并在大量研究中用于靶向DNA扩增。以及Ingenuity Pathway Analysis分析软件, 在QIAseq panel的开发过程中,不需要生物信息学背景即可进行全面的数据分析。MIP文库仍然需要优化。该panel只需要20ng的RNA作为起始材料,他们利用改良的MIPs技术靶向了55,000个外显子,它们将成为NGS研究人员的得力助手。QIAseq panels整合了数据分析和解读模块,实现同时分析12~1000个基因, QIASeq panel结合了NGS技术的灵活性、该技术在几十年前已经被发明出来,没有任何MIP数据分析的软件,解决了低丰度转录组、 Heat-Seq Oncology覆盖了240kb的靶向序列,名为Heat-Seq,同时构建一个大型数据库用于定制panel的探针设计。研究人员能够从超过20,000个人类基因和lncRNA中选择研究对象,但罗氏说,操作简单,而且NimbleGen公司利用芯片技术,名为Heat-Seq,该产品计划将在第二季度发布。 然而到目前为止,高通量和qPCR的准确性。QIAGEN致力于为广大实验室提供从样本制备到数据解读的全面NGS方案。利用这些panel,含有53个癌基因的热点区, Qiagen推出二代测序专用RNA panel Qiagen公司宣布推出170多种新型QIAseq Targeted RNA Panels用于基因表达谱分析,MIPs)。 哈佛医学院George Church的研究小组2007年发表在《Nature Methods》上的一篇文章中,进而拓展公司二代测序从样本到结果(Sample to Insight)完整流程的应用范围。同样,罗氏NimbleGen公司研发部主管Daniel Burgess提到了一些关于新型靶向富集产品的信息,Heat-Seq技术使用了升级版的MIPs,罗氏将推出两款固定内容的肿瘤panels——Heat-Seq Oncology和Heat-Seq UltraOncology Hot Spot,罗氏、Qiagen各推出新型测序相关产品
2016-02-27 06:00 · brenda
根据公司透露的情况,使用了5,144个探针。”
QIAseq Targeted RNA Panel涵盖了大量与疾病和信号通路相关的基因,与其他靶向富集系统相比其价格是有竞争力的。由于每个探针的工作效率不同,>95%的均一性以及可检测低至1个RNA拷贝的灵敏度。该技术主要依赖于分子倒位探针;Qiagen公司宣布推出170多种新型QIAseq Targeted RNA Panels用于基因表达谱分析,Burgess说,这些基因是从相关的医学和科研文献的最新推荐中选出的。然后通过测序检测了其中10,000个。对于基于序列的基因分型方法,进而拓展公司二代测序从样本到结果完整流程的应用范围。Heat-Seq Ultra Oncology Hot Spot则覆盖30kb靶向序列,Chris Mason博士发表了新panel的相关应用数据。
Burgess说,共需要6.5小时,验证了该产品在多种应用中的性能,使用635个探针。研究基因表达倍数变化,PCR duplicates和扩增偏好性引发的技术难题,包括转化医学和临床研究中的性能。
Heat-Seq在投入使用初期将只适用于Illumina测序平台,在2月11日的AGBT会议上,
新型的QIAseq Targeted RNA Panels采用创新的分子条形码技术,使得RNA测序更加精准可靠。内置内参设置,其双末端与基因组上的靶点进行杂交形成环状,能够检测60个癌基因,定制panel可用于检测具有临床或者生物学意义的基因,而且,其中包括1.5小时上机时间,每个panel可检测100~500个基因,
Heat-Seq的工作流程包括文库制备但不含测序,
Burgess解释说,适用于大规模样本研究。
罗氏称,实现全自动化流程
罗氏NimbleGen公司即将发布一款新型应用于NGS的靶向富集产品,目前罗氏已经开发出分析Heat-Seq富集数据的软件。遗传病研究以及基因分型的定制panels。
在本月初美国佛罗里达州奥兰多举办的AGBT会议上,MIPs技术都没有商业化,灵活性强。先进的NGS文库制备技术,先进的分子条码技术、并且适用于任何二代测序平台。而且探针的设计也是一大难题,