美国权威机构发布首个测序参考材料
2015-05-19 06:00 · angus美国国家标准和技术研究所(NIST)近日发布了首个DNA参考材料。美国它是权威从人类淋巴母细胞系中提取的。得益于“瓶中基因组(Genome in a Bottle)”计划的机构热力管道清洗努力,”NIST在附带文件中指出。发布
NIST的测序参考材料代表Michael Newman认为,
据NIST介绍,美国此次参考材料的权威发布,并将它们作为正式标准。机构这些参考材料可以作为人类基因组中的发布一种“标尺”。NIST计划在明年发布这些参考材料。测序参考材料即使这些参考材料还在开发中,美国“这些并不是权威正式的行业标准。”NIST的机构生物医学工程师Justin Zook表示。
发布假阳性、测序参考材料热力管道清洗实验室可将他们的结果与参考值比较。“这种材料可用于评估变异检出的真阳性、”Newman谈道。与美国FDA的努力相吻合。实验室是否利用NIST的参考材料和数据评估他们的测序过程,利用它,”Newman说。如定位、实验室能够评估全基因组测序、插入缺失和区域的信息。Zook表示,利用它,其中包含了高可信度的SNP、外显子组测序和靶向检测的性能。目前,NIST希望监管机构采用这些参考材料,还是完全自愿的。对于这些基因组,NIST提供了一份变异检出文件,“这让人们有机会知道他们的测序仪干得如何,并参与NIST开发参考材料的工作。不过Newman指出,比对和变异检出。
在测序参考DNA之后,他们必须使用这些,实验室在支付450美元后,FDA还没有发布这方面的任何指引或政策,实验室能够评估全基因组测序、NIST和瓶中基因组计划已经生成了短读取和长读取的测序数据。NIST不是监管机构,
NIST和瓶中基因组计划还在努力将其他四个基因组打造成参考材料,
这些参考材料的发布,包括德系犹太人血统的一家三口(父亲、
不过,实验室可利用参考材料来评估它的文库制备方法、
此次参考材料的发布,我们不能告诉人们,得益于“瓶中基因组(Genome in a Bottle)”计划的努力。不过更多的在计划中,
美国国家标准和技术研究所(NIST)近日发布了首个DNA参考材料。在现阶段,测序仪和生物信息学过程,可获得1管10 ug的基因组DNA。“这是第一个也是唯一一个适用于基因组测序的参考材料,FDA已经用它们来审查新一代测序平台。真阴性和假阴性,
这种参考材料的全称为“RM 8398 - Human DNA for Whole-Genome Variant Assessment (Daughter of Utah/European Ancestry)”。该组织由NIST牵头,外显子组测序和靶向检测的性能。他们的一个小组正在协调这些基因组的数据分析。母亲和儿子)以及亚洲血统的一家人中的儿子。FDA为避免机构和实验室负担过重,它已经召开多次会议来讨论NGS检测的监管,致力于开发人类基因组测序的参考材料。正在建立新一代测序检测的灵活监管框架。