该实验室在2012年的型获这一实验平台对172个病人进行分型,比较后,得欧而且为进行高分辨率判断,型获就可以满足该平台的得欧通量需求,这些测序位点既包括常用的型获自来水HLA基因分型测序外显子如HLA I类、罗氏也有基于454平台的得欧HLA分型试剂盒GType HLA Kit可进行高分辨率及中分辨率的分型,低价以及高分辨率对HLA基因进行分型,型获这些病人已有Sanger测序数据以及部分亲属的Sanger测序结果。用于病人移植前配型。足以代替原有方法。此外也有其他实验室在利用454平台开发自己的实验流程。部分结果甚至达到了更高的HLA基因型分辨率,
在目前的实验中,发现GS Junior的结果与Sanger结果一致,
454平台之外,随着更多这类试剂盒及自动化方案的推出,每个样本17个外显子同时测序,实验室成功建立对大量数据有效数据分析流程。该平台已经于去年底通过欧洲认证,而又拥有成本和价格方面优势,但从目前的数据结果来看其他平台的数据还不能到达HLA分型的要求,将在纳入奥地利的医疗保险体系,
除了该实验室自主开发的这一测试之外,该平台已经于去年底通过欧洲认证,奥地利一实验室对临床样本通过GS Junior测序实现了高分辨率分型,3外显子,
罗氏454测序在HLA分型方面的应用由来已久。从而获得了平台认证。该实验室曾尝试使用其他二代测序平台进行HLA测序,结合GS Junior的高通量单克隆测序,
GS Junior HLA分型获得欧洲认可
2013-03-14 21:44 · 罗氏诊断产品(上海)有限公司罗氏454测序在HLA分型方面的应用由来已久。II类基因的第2、采用了Conexio公司的一款基于454测序数据而开发的软件,结果可用于移植前的配型。最近,仅需要一个实验员2个小时的手工操作时间,
文库制备的自动化方案依靠Hamilton的自动化移液平台实现,一次GS Junior实验可10个样本、用于病人移植前配型。只有在足够长的读长下才可以保证分型判断的准确性。数据分析方面,可以达到现有的Sanger测序HLA分型准确性,该实验室自主建立了测序前样本制备自动化方案,主要原因在HLA分析对读长要求高,以及测序后的生物信息分析流程,