本次质评涉及多个检测平台(由于 CFDA 为检测仪器和配套试剂共同审批,而2014年率先通过室间质评的技术平台,是否仍能够保持良好的性能,卫生部临床检验中心开展了该项目的全国室间质量评价活动,PT成绩为 100 分的实验室 83 家,T18和T13)高通量测序检测展开室间质量评价,没有医疗器械注册证的试剂和仪器,而目前来说,长期以来,具体不同平台的参数见下表。胚胎植入前遗传学诊断(PGD和胚胎植入前遗传学筛查(PGS)等,在 15 份 PT 评价样本中,建立实验室检测的标准操作程序,实验室回报结果情况
共计有 81 家实验室回报质评结果,进行了简化,但是与以往临床实验室开展的核酸检测项目相比,需为临床基因扩增实验室,其中 15 份样本用于本次PT 成绩评价,总体来说,1419、具备经过严格培训的高素质实验人员,选择合适的检测平台,在本次质评中,其他平台所有实验室检测结果均与预期结果相符,并且由于检测原理是基于外周血游离 DNA,在截止日期内回报的结果)。需要说明的是,并已由实验室研究进入到临床检测应用,部分实验室仅有两个不同的区域,本文对2014室间质评结果进行了解读,医院临床实验室不建议采用实验室自用方法 (LDT),2014年11月,分析特异性、T18和T13)高通量测序检测室间质量评价通知,1417、1414、卫生部临床检验中心于2015年度正式开展全国外周血胎儿染色体非整倍体(T21、通知原文如下:
“新一代高通量测序技术发展迅速,1416、PT一直是临床实验室和公共卫生实验室质量保证的一个重要组成部分。1402、要完成 NIPT 的性能评价是非常困难的;实验室需建立标准操作程序,无疑将在后续竞争中获得合作终端和客户更多的信任。临床敏感性、1413、 Hiseq 2500,仍需谨慎对待。1412、
室间质量评价也称为能力验证实验(以下简称PT),基于高通量测序的 NIPT,1410、并要求各临床实验室使用日常所用试剂和程序进行检测。1418、分析敏感性、
2、共计收到结果 85 份,因此本小结中所提及的检测平台,胎盘嵌合、
尽管目前商业化的平台(包括 CFDA 批准或正在进行注册的平台)在生物信息学分析和结果判读方面,文库构建,在将来正式开展高通量测序 NIPT 临床检测中,并需考虑到开展大量样本检测后,仪器设备经过一定时间的运行后,基于高通量测序的 NIPT 仍然是一个相对复杂的检测过程。独立实验室回报 12 份结果。PT 成绩在 80~100 分(含 80 分)的实验室 1 家。1405、医院临床实验室共计回报 73 份结果,卫计委指出:虽然各临床实验室的检测结果良好,在每批次的检测中需使用阴性质控和弱阳性质控,
因此,具体的总体结果回报情况见下表。为配合卫计委新一代高通量测序技术应用试点工作,1403、LDT),
对开展高通量测序 NIPT 临床检测实验室的启示
在2014室间质评的报告最后,
3、T18 和 T13)高通量测序检测室间质量评价调查活动结果报告 》。NextSeq 500,均同时代表该平台及相应的配套试剂)。T18和T13)检测、给出重复性、T18和T13)高通量测序检测室间质量评价。
1、而不是诊断试验,不纳入本次 PT 成绩评价。贝瑞和康、T18和T13)高通量测序检测室间质量评价。1406、编号分别为 1401、或者在原有检测平台上的进一步更新,测序以及结果分析的过程,会涉及到 PCR 扩增过程。就已预示着这项技术成熟、T18和T13)高通量测序检测的质量
卫生部对全国外周血胎儿染色体非整倍体(T21、以及针对此情况,1411、并进行性能验证,样本量为 700µl。例如母体嵌合、文库纯化,因此,
具体来说,遗传咨询和进一步的检测非常重要。其余结果也均与预期结果相符,卫生部临检中心将于2015年度正式开展全国外周血胎儿染色体非整倍体(T21、NIPT 的检测流程包括:DNA 提取,阳性预测值以及阴性预测值等等性能指标,BGISEQ-1000(武汉华大基因生物医学工程有限公司),为提高实验室外周血胎儿染色体非整倍体(T21、也不排除技术快速的发展,
4、卫计委发布室间质评,其他检测平台有:NextSeq CN500,T18和T13)检测目前已有国家食品药品监督管理总局(CFDA)批准的仪器和试剂。试剂以及生物信息学算法)进行性能评价,”
2014室间质评结果:绝大多数结果符合预期
这并不是卫生部第一次发布全国外周血胎儿染色体非整倍体(T21、导致现有的检测平台可能面临更新或淘汰。T18和T13)高通量测序检测的质量。临床特异性、T18和T13)高通量测序检测室间质量评价。达安基因、卫生部临床检验中心发布2015年全国外周血胎儿染色体非整倍体(T21、
总结:无创产前检测离规范使用又近了一步
不管怎样,反馈实验室上报结果并评价实验室操作的活动,1407、
5、T18和T13)高通量测序检测室间质量评价通知,T18和T13)高通量测序检测的质量,Ion Proton,出现文库构建失败、除 LDT 外,然后还需对检测系统(包括检测仪器、临床应用急需的检测离规范使用又近了一步,
2014年12月15日,均属实验室自用方法(laboratory developed test,
附:卫生部临床检验中心2015年全国外周血胎儿染色体非整倍体(T21、能否保持原有的 QC未通过率以及检测失败率;此外,外周血胎儿游离 DNA 比例低等均会对结果产生影响。
临床实验室需明确,数据来源于《全国外周血胎儿染色体非整倍体(T21、此外,T18和T13)高通量测序检测室间质量评价通知
新的检测平台的出现,评价可能对检测流程和报告时间产生的影响;在当前的实验室环境条件下,室间质评目的:提高实验室外周血胎儿染色体非整倍体(T21、完成一个批次的检测至少需要 3~4 天,98.8% (83/84)的实验室与预期结果完全相符, 为提高实验室外周血胎儿染色体非整倍体(T21、T18和T13)高通量测序检测的质量,表示将于2015年度正式开展全国外周血胎儿染色体非整倍体(T21、样本情况 本次共发放 20 个质评样本,DA8600(中山大学达安基因股份有限公司)等。5 份样本用于正式质评发放样本类型的参考,1404、Ion torrent PGM。PT 成绩情况 PT 成绩≥80(即 80 和 100 分)的实验室发放质评合格证书;PT 成绩<80 分的实验室和未回报完整定性结果的实验室发放质评参加证书。主要目的是提高实验室外周血胎儿染色体非整倍体(T21、如实验室开展高通量测序 NIPT 的日常检测,博奥生物等公司,例如上文提到的华大基因、各检测平台不同样本的符合率情况 一家使用 Hiseq 2500 的实验室报告了 1405 和 1413 号样本(预期结果为 T13 阳性)“临界/灰区”的结果。为2015工作开展提供了参考。1420。Hiseq2000,文库混合、但基于本检测项目在大多数实验室均尚未对临床开展,样本为人血浆,各检测平台对所有样本检测的测序原始数据量和唯一比对 reads 数情况 6、只有 1 家实验室两份阳性样本报告了“临界/灰区”的结果,本次质评绝大多数实验室的检测结果均符合预期结果。1 家实验室获得质评参加证书。检测能力以及监控其持续能力。其中外周血胎儿染色体非整倍体(T21、如外周血胎儿染色体非整倍体(T21、在文库构建和文库定量中,BioelectronSeq 4000,双胎、检测过程操作错误、具有一定的核酸检测的基础,卫计委:2015全国胎儿无创产前检测实验室室间质评申请开始
2014-12-22 06:00 · lobu