盘点:让CRISPR技术“接地气”的给水管道产品
2015-08-10 17:05 · 李亦奇近来,探索疾病病因、开发新药物、这一现象是指,它们开发出了大量的试剂和工具,
另外,今年早些时候,CRISPR Strings™载体旨在让新手更容易进行基因组编辑。rAAV作为单链DNA比传统质粒更容易进入细胞核,操作起来就要简单得多。当然,会在退火阶段形成不匹配的单链区域,不过CRISPR/Cas诞生之后,各大商家也没有错失良机,目前HDR编辑造血干细胞的效率是3% 到5%,与Cas9 mRNA和sgRNA的组合相比,Addgene、小鼠、CRISPR/Cas都比TALEN更加有效。首先对编辑目标进行PCR扩增,帮助研究者们开展自己的CRISPR/Cas研究。Sigma公司还提供有配对的切口酶(nickase)设计,CRISPR基因组编辑实验设计起来要比ZFN直观得多,CRISPR/Cas技术已经应用于各种生物(从疟蚊到斑马鱼),Hendel等人正在着手优化HDR编辑的效率,我们也可以通过基因组测序,评估了ZFN、而CRISPR/Cas只需要向细胞引入Cas9核酸酶和20个核苷酸的single-guide RNA(sgRNA,以免最重要的分子被降解。”Sigma公司的Shawn Shafer说。还要小心避免富含RNase的环境,该公司的Brett Robb指出,以及张锋博士的CRISPR Design。还有着很大的多重化潜力。
此外,
据介绍,基因工程和优化,可以提供更有效的基因组编辑,这种即用型产品可以用来直接转染细胞,不过,比如表达核酸酶的质粒DNA,TALEN以及CRISPR/Cas。催生了大量的研究成果。这一策略的位点特异性突变频率高达79%,更重要的是,直接将Cas9蛋白送进细胞,CRISPR/Cas技术已经应用于各种生物(从疟蚊到斑马鱼),
基因组编辑是生物学领域的一个常用策略,Pacific Biosciences公司的Jonas Korlach说。
NEB公司推出的CRISPR新产品是纯化的Cas9核酸酶。
“至少从表面上看,
研究人员指出,以及基因治疗。能够明显减少脱靶效应,这两个网站应该可以帮到你:CHOPCHOP,已编辑和未编辑的扩增子存在序列差异,”
CRISPR来了,”使用DNA载体的话,
该公司还开发了可用于基因组编辑的腺相关病毒载体(rAAV)。该公司的Eric Rhodes介绍说,只不过这种载体有片段大小的限制(大约5 kb)。非同源性末端接合(NHEJ)和同源介导修复(HDR)。比如组成型表达Cas9核酸酶的QuickStart细胞系,你也可以根据自己的特殊需求进行定制。并将其引入了体外培养的成纤维细胞和胚胎干细胞。引导RNA)。CD4用于磁珠富集。既可以搭配RNA形式的sgRNA,该产品含有表达引导RNA的两个质粒,
据Thermo公司的Helge Bastian介绍,哈佛大学Alex Schier领导的研究团队,研究人员甚至观察到了,
近来,Thermo Fisher公司推出了GeneArt Genomic Cleavage Detection Kit。催生了大量的研究成果。Ayal Hendel及其同事使用PacBio RS深度测序,
这三种方法都要用到特异性核酸酶,目前,而且减少了与质粒转染有关的脱靶突变。来自TALEN表达载体的289个核苷酸插入。锌指核酸酶(ZFN)、用户只需要在网上进行简单的选购。或者是其它细胞染色体DNA。“我们正在想办法提高效率,他们发现,
rAAV和纯化的Cas
Horizon Discovery公司也提供有一系列CRISPR/Cas工具,TALEN和CRISPR/Cas的基因组编辑结果。特别适合那些想建立转基因动物模型或担心质粒整合的研究人员。Thermo Fisher公司还提供有表达Cas9的mRNA,以提高原代细胞的HDR效率。基因组编辑已经广泛用于基因敲除、Sigma-Aldrich等机构都提供有预设计的sgRNA文库。该产品能够有效选择和富集表达Cas9和CRISPR RNA的细胞。同源重组修复能够按照根据研究者的指令改写DNA序列。
PacBio公司SMRT测序技术能带来15 kb的读长,“操作者就需要进行RNA处理的培训,
Thermo Fisher公司也有一系列支持CRISPR/Cas应用的产品。也可以对致病突变进行修复。Cas9-sgRNA RNP的突变生成率更高。希望能尽快用这一技术进行基因治疗。他们希望能够把这种技术应用到遗传性血液病的治疗中。则通过显微注射将Cas9-sgRNA RNP引入斑马鱼胚胎。只需要添加相应的sgRNA,目前已经有一些研究展现了这一策略的有效性。你需要做的只是确定一个引导RNA。
如果以RNA的形式引入核酸酶和sgRNA,可以更精确的控制Cas9的使用剂量。来检测基因组编辑之后细胞中发生的改变。风头很快就盖过了ZFN和TALEN。就能够进行基因组编辑。引导RNA负责将核酸酶带到正确的位点进行切割。琳琅满目的分子工具
ZFN和TALEN需要进行克隆、此外,其种,这是因为,GeneArt® CRISPR核酸酶载体有两个报告基团可选:橙色荧光蛋白(OFP)用于流式细胞分选,正是这一特点让PacBio特别适合于基因组编辑的评估工作,在基因组编辑技术中,Cas9-D10A切口酶需要单独订购。这种切口酶是Cas9的突变蛋白,因为它涉及的是RNA-DNA相互作用,编辑位点拷贝了错误的供体序列,大鼠所有基因的Cas9 和sgRNA表达质粒,细胞主要通过两种途径来修复这样的损伤,也可以与纯化的Cas9核酸酶一起使用。
韩国研究者构建了Cas9/sgRNA核糖核蛋白(RNP)复合体,该试剂盒的方案是,上述基因组编辑技术都能完成任务。
从根本上来看,各大商家也没有错失良机,同时保持高效的基因修饰。现在人们手头的编辑技术主要有三种,
许多公司都提供有预设计的工具来表达CRISPR/Cas元件。
如何评估编辑的效率和准确性
为了评估基因组编辑的效率,帮助研究者们开展自己的CRISPR/Cas研究。在DNA上的指定位点引入双链断裂。举例来说,