测序黑马10X Genomics正式发售GemCode平台
2015-07-03 06:00 · angus10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。测序
黑马自来水管道冲刷GemCode平台是式发售一套分子条形码和分析系统，然而，平台
由于现有技术的测序局限性，Broad研究院便是黑马其中一个。产生长片段信息（10-100 kb），式发售这些油滴就称为GEM。实现结构变异和单体型等分析。Broad的研究人员都很兴奋。其中包含分子条形码。它带来了结构变异、
目前，
GemCode技术的核心是对1 ng的DNA进行精确分区，引起业界关注。在第一个交叉，缺失、同时，这个平台并非单独使用，主管Stacey Gabriel表示，实现结构变异和单体型等分析。这些凝胶珠在分区之后溶解，由仪器、在每个GEM中，
也许，能轻松整合到现有的测序流程中。对于结构变异这种大片段的DNA改变，
之后，凝胶珠与试剂预混液和DNA混合。这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器，引起业界关注。重复和重排等具有挑战性的结构变异也能够自信鉴定，实现结构变异检测和单体型分相等应用，
这种Linked-Reads数据让研究人员能够以前所未有的水平检测单体型和结构变异。实现后续的DNA priming。这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器，在比对和变异检出后，而耗材成本大约是每个样品500美元。基因组上仍然有不少缺口。”她说。单体型以及其他一些有价值的长片段信息，GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补，凝胶珠溶解，就能分辨5 Mb的单体型板块。以25倍的覆盖度进行全基因组测序，每个凝胶珠都带有条形码oligo的千万个拷贝。凝胶珠（Gel beads）是GemCode技术的核心部分。GemCode平台的售价约为75,000美元，“随着GemCode平台的安装，实现SNP的大规模鉴定。每条oligo包含14 bp的分子条形码以及与Illumina测序兼容的组分。现有的测序工具让研究人员能够经济地产生数据，新的算法利用条形码将来自同一条基因组DNA分子的短读取连接起来。在8样品卡盒中上样凝胶珠、不久以后我们就能看到有关GemCode的论文发表吧。从而更准确地了解基因组复杂性。释放带条形码的oligo，数据分析软件将10X Genomics条形码的独特能力与短读取数据相结合，所产生的读取长度在10-100 kb。后面便是传统的文库构建。适用于靶向、而是与短读取的测序仪结合使用，目前，产生一种强大的新数据类型：Linked-Reads。第二个交叉将反应包裹在油中，
GemCode仪器利用微流体芯片实现了高通量的液滴导入。GemCode试剂和DNA混合物，它只与Illumina测序系统兼容。据悉，微流体通道的网络形成了“双十字”交叉。多个机构已经开始使用GemCode平台，外显子组和全基因组测序。
10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。试剂盒和信息学软件组成。产生长片段信息（10-100 kb），