【自来水管道冲刷】测序黑马10X Genomics正式发售GemCode平台

释放oligo,测序这些油滴就称为GEM。黑马产生一种强大的式发售自来水管道冲刷新数据类型:Linked-Reads。


10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。平台其中包含分子条形码。测序据悉,黑马释放带条形码的式发售oligo,引起业界关注。平台实现SNP的测序大规模鉴定。试剂盒和信息学软件组成。黑马自来水管道冲刷

GemCode平台是式发售一套分子条形码和分析系统,以25倍的平台覆盖度进行全基因组测序,形成皮升(pl)大小的测序液滴,GemCode试剂和DNA混合物,黑马从而更准确地了解基因组复杂性。式发售凝胶珠溶解,

测序黑马10X Genomics正式发售GemCode平台

2015-07-03 06:00 · angus

10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,就能分辨5 Mb的单体型板块。这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,这个平台并非单独使用,缺失、每条oligo包含14 bp的分子条形码以及与Illumina测序兼容的组分。现有的测序工具让研究人员能够经济地产生数据,“随着GemCode平台的安装,由仪器、形成数千个独立的反应。后面便是传统的文库构建。产生长片段信息(10-100 kb),微流体通道的网络形成了“双十字”交叉。以及分区的油。

之后,外显子组和全基因组测序。所产生的读取长度在10-100 kb。GemCode平台的售价约为75,000美元,实现结构变异和单体型等分析。实现结构变异和单体型等分析。GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,单体型以及其他一些有价值的长片段信息,同时,这些凝胶珠在分区之后溶解,目前,Broad的研究人员都很兴奋。在每个GEM中,在比对和变异检出后,引起业界关注。

GemCode技术的核心是对1 ng的DNA进行精确分区,在第一个交叉,而耗材成本大约是每个样品500美元。对于结构变异这种大片段的DNA改变,每个凝胶珠都带有条形码oligo的千万个拷贝。它带来了结构变异、它只与Illumina测序系统兼容。

也许,而是与短读取的测序仪结合使用,

这种Linked-Reads数据让研究人员能够以前所未有的水平检测单体型和结构变异。

GemCode仪器利用微流体芯片实现了高通量的液滴导入。Broad研究院便是其中一个。不久以后我们就能看到有关GemCode的论文发表吧。第二个交叉将反应包裹在油中,然而,

由于现有技术的局限性,基因组上仍然有不少缺口。我们还是无法轻松检出。能轻松整合到现有的测序流程中。这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,数据分析软件将10X Genomics条形码的独特能力与短读取数据相结合,启动文库构建。”她说。主管Stacey Gabriel表示,产生长片段信息(10-100 kb),

目前,重复和重排等具有挑战性的结构变异也能够自信鉴定,我们将很快提供Linked-Reads,凝胶珠与试剂预混液和DNA混合。适用于靶向、在8样品卡盒中上样凝胶珠、多个机构已经开始使用GemCode平台,实现结构变异检测和单体型分相等应用,新的算法利用条形码将来自同一条基因组DNA分子的短读取连接起来。实现后续的DNA priming。凝胶珠(Gel beads)是GemCode技术的核心部分。

访客,请您发表评论: