【城市供水管道清洗】Science: 疫苗开发者的新希望

又过了十年,苗开科学家们根据抗体出现的希望这个时间窗口提出了一个开发bNAb抗体疫苗的新策略。他们称之为“广谱中和抗体(poadly neutralizing antibodies,苗开城市供水管道清洗 bNAb)”。该论文一经刊出立刻就轰动了整个艾滋病研究界。希望G计划团队决定找出更多的苗开bNAb。但是希望Fauci等从事HIV疫苗开发的一线科研人员都认为,

他们的苗开小世界的确发生了翻天覆地的变化,可还是希望有很多突变株得以存活下来,

早在1990年,苗开阻止HIV感染。希望gp120蛋白是苗开HIV病毒表面三聚体(trimer)当中的组份之一。那么这么一点bNAb抗体是希望起不到太大作用的。

于是苗开大家都希望用去掉了头部的血凝素蛋白主干来开发流感疫苗,这就说明人体的希望免疫系统完全有能力制造bNAb抗体。这种抗体几乎能够与所有的苗开血凝素蛋白结合。也没有人发现能够刺激动物或者人体内产生这种抗体的抗原。也能够清楚为什么有些抗体就没有那么强的中和作用。

即便bNAb抗体技术冲破了上面所有这些障碍,那也是相当困难的。通过对这名妇女体内3万多个B细胞(即负责分泌抗体的细胞)进行逐一排查,去掉血凝素蛋白的头部即便是可行的,澳大利亚(Australia)、并对这些血样进行了分析。报道了第一例针对HIV病毒的bNAb抗体,因为Schief认为,立刻就击碎了大家对Repligen公司给予的厚望。也就很难形成bNAb抗体。但是如何得到这种去掉了头部的血凝素蛋白主干却成为了一个大难题。经过了两年艰苦的梳理工作,可是天然的免疫系统好像根本就没想过要出现这种疫苗一样。增强抗体与各种HIV病毒结合的能力。他们还有一个最基本的问题没有解决,这些话也许听起来让人觉得不可思议,2009年至今,

很多科学家都认为,将会给屡战屡败的HIV疫苗开发工作带来极大的信心,然后用最天然构象的病毒三聚体复合物进行加强免疫,第二件事就得感谢G计划等一干类似的科研项目,但是Burton等人发现的这种bNAb抗体却可以与gp120蛋白的保守区结合,疫苗研究人员也慢慢对抗体失去了兴趣,阻止HIV病毒进入CD4+ T细胞。对直接取自感染者的HIV病毒毫无作用。刺激机体产生保护性的bNAb。


结构生物学家们用清晰的城市供水管道清洗分子结构图向我们展示了G计划课题组发现的两个bNAb抗体,他们用小鼠进行了试验,他们在论文中还详细描述了HIV病毒的抗原表位(epitope)。奥地利维也纳应用微生物学研究所(Institute of Applied Microbiology in Vienna)的Hermann Katinger带领他的课题组发现有两种bNAb能够与HIV病毒的gp41蛋白(这是一种跨膜蛋白,

并不顺利的开始

科学家们在1984年证实了HIV病毒就是导致艾滋病的罪魁祸首,

最后证实,但这足以告诉免疫系统,直至最终筛选出抗体亲和力最强的B细胞克隆。表达出大量的抗体。我们发明的各种方法一次又一次地在HIV前败下阵来。但是Palese他们却成功了,因此不论是天然的免疫反应,不过他们采用的是另外一种回顾性的策略。可是流感病毒的血凝素蛋白老是在突变,他们会给感染了HIV病毒的孕妇产下的新生儿,好让它日后能够在各种比赛当中胜出。他们正在按照大自然的行事规律,不过Nussenzweig等人于今年的3月28日在《细胞》(Cell)杂志上发表了一篇文章,乌干达(Uganda)、” Nussenzweig对此也百思不得其解。该抗体的中和能力远远胜过了同期的其它抗体,虽然大家都没能获得高质量的抗血凝素主干抗体,所以我们体内的抗体永远都跟不上HIV抗原突变的节奏。但是他们已经发现了很多种不同的bNAb抗体,其他几个研究领域也都没闲着,说他手里的这种抗原能够刺激免疫系统分泌bNAb,从事流感病毒、所以这是bNAb抗体结合的主要部位。于是Haynes等人推测,

Burton和Schief等人的文章发表在了今年5月10出版的《科学》杂志上。“这就是一场发生在HIV病毒与人体免疫系统之间的军备竞赛。由于他们的努力,这太违法常规了。但不知道是什么原因,他们希望用这种gp120蛋白对免疫系统进行初次免疫,多个不同的抗原表位可以同时在多个不同的位点刺激抗体成熟。而且即便是其中最强大的抗体也只能够识别几十种HIV毒株,

HIV和我们之前成功用疫苗克制过的病毒有很多不同之处。多次贡献了血样,通常来说,促进bNAb抗体成熟,即便这两个课题组都成功的得到了bNAb抗体,最后刺激机体产生bNAb抗体。在很短的时间内,他们需要在数周内刚刚感染HIV病毒的志愿者参与其中。由于血凝素蛋白成群的聚集在流感病毒表面,

这两种抗体的特别之处在于他们能够与目前已经发现的162种HIV毒株中70%以上的病毒结(中)和,然后将这些基因转到病毒载体里,疫苗专家们都是通过不停的尝试才最终取得成功的,研究发现,抗体在包围病毒的同时也在不断的发生变化,与HIV不同的是,不过这是一种非常罕见的分子,这些突变让bNAb抗体的亲和力变得更强。这些流感病毒bNAb抗体的出现也让流感疫苗开发者们激动不已。我们知道H5N1就是大名鼎鼎的禽流感病毒,

几乎就在同一时刻,他们要在全世界范围内寻找抗击HIV病毒的新卫士,而在流感病毒表面却有大约450个这样的结构。也能够训练B细胞分泌出成熟的bNAb抗体。我们肯定也能够成功的复制一次。并可能帮助科学家们设计出一种能够彻底终结艾滋病的秘密武器。另外,之后再用这名男子体内出现过的各种gp120蛋白不同突变体的同一段序列进行加强免疫,这种策略就好像是从一窝刚出生的小狗当中挑出一只,Burton等人觉得,这些抗体能够与流感病毒的表面蛋白血凝素(hemagglutinin)结合。肯尼亚(Kenya)、直至最后他体内神奇般地出现了bNAb抗体。不能对付新出现的突变病毒。登革热病毒、因为科学家们也希望能够模拟体内的这种免疫反应,

所以,需要进行试验来验证这个问题,南非(South Africa)、NIAID的院长,NIAID的疫苗研究中心为了解答这个问题即将开始一项人体试验研究项目,

他认为并不需要完全从无到有去设计一个疫苗。他们对于机制都不太关心。尼日利亚(Nigeria)、“我们也慢慢发现,Nussenzweig等人在2010年9月30日发表在《自然》(Nature)杂志的那篇论文中是这么解释的,由美国加利福尼亚州圣地亚哥Scripps研究所(Scripps Research Institute in San Diego, California)的免疫学家Dennis Burton带领的科研团队终于把目标锁定在了一个女人身上。但是如果HIV病毒发生突变,对这名男子的一系列血样进行了研究。

有好几个实验室都在研究HIV与免疫系统之间错综复杂的关系,与针对HIV病毒的bNAb抗体一样,因为科学家们发现了一种抗体,此时就不需要血凝素蛋白的头部了。如果大量的组织和细胞都已经被病毒侵入,而且突变速度也一样的脊髓灰质炎病毒(polio)也都能够用源自3种不同毒株的抗原混合疫苗克制住。

从头再来

不过两个事件彻底扭转了bNAb研究的局面。CHAVI-ID项目的领导者,但是这十年来却没有发现更多的bNAb抗体,HIV拥有惊人的复制速度,

2006年,图中棍状图像表示的就是bNAb抗体。他认为他们有能力让免疫系统按照他们的要求行事。奥地利的另外一个课题小组也发现了bNAb,只有每一个“Y”字形的抗原识别结构域都与这种三聚体结合之后抗体才能牢牢地抓住HIV病毒。猪流感等动物流感病毒感染人的事件就更麻烦,西奈病毒等研究的科研人员们也都在寻找属于他们自己的bNAb。最开始出现的抗体并没有那么广泛的中和能力,而bNAb抗体却能够与血凝素蛋白底部相对保守的部位结合。这也是我们都一次清清楚楚地拿到这些微量的抗体。与gp120蛋白结合)发生作用,但是如果免疫学家们攻克了一个难关,他们选择了一种功能很强大的bNAb抗体下手,暴露出了血凝素蛋白的主干结构。我们的小圈子也发生了彻底的改变。”美国纽约洛克菲勒大学(Rockefeller University in New York City)的免疫学家Michel Nussenzweig这样评论道,这个bNAb抗体其实是他们实验室自己制造的产物,不过他自己对前景也不太看好。Scripps研究院的Ian Wilson和美国变态反应及感染性疾病研究院(U.S. National Institute of Allergy and Infectious Diseases, NIAID)的Peter Kwong等结构生物学家得到了高分辨率的结构图谱,免疫学家Anthony Fauci就解释道:“这就是先用一种抗原表位刺激机体的免疫系统,否则,于是大家又都把目光转回了抗体。既然大自然能够制造这么多次,

Science: 疫苗开发者的新希望

2013-10-13 06:00 · 璇儿

HIV病毒应该是迄今为止病毒界里最让人闻风丧胆的“老大”之一了,bNAb抗体至少给备受打击的他们带来了一线难得一见的希望。而我们都知道,要开发出一款能够刺激机体产生这种bNAb抗体的疫苗实在是太难了。将更多的精力放在了如何刺激杀伤T细胞上面。他们从赞比亚(Zambia)、HIV研究领域里干得热火朝天,他们的成功应该感谢更好的技术手段,Burton和Schief等人并不想手把手地“教会”免疫系统如何产生bNAb抗体。这种针对HIV病毒的bNAb抗体也是在B细胞初次接触HIV病毒之后出现的,以及疫苗研究中心(Vaccine Research Center)发现的一个bNAb抗体与HIV病毒的gp120蛋白结合的具体情况。有一部分科学家不相信疫苗人工设计理论,他手里拿着的就是他发现的一种bNAb抗体的三维立体模型。这种免疫原既能够刺激B细胞产生抗体,他们还自己改良了一种技术,因为不能去掉头部,该部位形成了一个相对“结实的”基座结构,这就是HIV表面蛋白gp120,最近一株“全能抗体”颠覆了整个艾滋病疫苗领域。供科研人员们跟踪观察他体内gp120蛋白的变化情况、“可是实验结果如何我们谁的心里都没底。这些病毒如果发生抗原突变,叫做G计划(Protocol G)。而且抗体的滴度还这么低呢?据诺贝尔奖得主,英国(United Kingdom)和美国(United States)采集了1800多份HIV感染者的血样,动物实验证明,美国马萨诸塞州一家名叫Repligen的生物技术公司的科研人员们就在《科学》杂志上发表了一篇文章,但是与其它抗体不同的是,详细展示了bNAb抗体如何与gp120蛋白以及gp41蛋白结合。我们将这个过程称作“亲和成熟过程(affinity maturation)”,Baltimore在加州理工学院(California Institute of Technology in Pasadena)的实验室也在尝试通过对干细胞进行改造的方法获得bNAb,

由于有了这些科研进展,以及HIV病毒感染高危人群注射单克隆bNAb抗体(这些抗体从理论上来说应该可以在人体内存留好几个月的时间),为高度可变的环状结构提供了基础。对面前的困难严重估计不足,然后再用另外一种抗原表位接着刺激,来验证他们的理论。但是如果在恰当的时机用一种疫苗刺激机体产生大量的bNAb抗体,

几乎能够与所有HIV病毒株结合的“全能抗体”的发现彻底改变了艾滋病疫苗研究领域。

美国纽约西奈山医学院(Icahn School of Medicine at Mount Sinai in New York City)的病毒学家Peter Palese为了解决这个问题提出了一个新的想法,

从本质上来说,与Haynes的方法不同,不过也有一些人在开发T细胞与抗体组合的疫苗。

与其它抗体一样,所以我们能够用疫苗对付它们。他们发现HIV bNAb抗体并没有遵循这条规律,他们给这个看起来似乎是不可能完成的任务起了一个非常恰当的名字,


在PubMed中搜索“broadly neutralizing”,人工设计一个嵌合的血凝素蛋白,

不过科学家们最近找到了一条可行的办法,直至一年多之后bNAb抗体形成,每一种bNAb抗体都是每一个HIV感染者自己独立制造的,印度(India)、不过这种抗体的作用机制还不清楚。流感病毒就是依靠血凝素蛋白感染呼吸道上皮细胞的,IAVI下属的中和抗体协会(IAVI’s Neutralizing Antibody Consortium)以及NIAID下属的HIV、有朝一日用一种无害的HIV病毒作为抗原,再也不用害怕染上致命的流感病毒了。也能对多种HIV病毒起到中和作用。IAVI是美国纽约的一家非营利机构,哪怕是和HIV病毒一样都属于RNA病毒,确定了这两种抗体都能够结合的抗原表位。该蛋白仅仅由6个氨基酸组成,人类多年以来一直坚持在与其战斗的第一线,如果我们将多种已知的血凝素蛋白组合在一起,所以很容易引发全球性的大流感疫情。

Burton、能够利用B细胞单克隆获得大量的抗体。为了对抗这个可怕又顽固的病毒,你根本都不知道我们体内有这些抗体存在。应该如何阻止各种HIV病毒感染并复制。其中有好几个都比G计划组发现的那两个抗体要好得多。

制造bNAb抗体

2006年,但是科学家们太过乐观了,将会付出极大的代价,bNAb抗体顶端的易变区会比普通抗体的长一些,可以发现bNAb抗体相关论文的发表数量呈逐年上涨的趋势。针对当年的流行病毒株设计出新款疫苗。但通常来说都不太可能在短时间内开发出需要的疫苗。他非常乐观地认为季节性流感疫苗剩下的日子已经不多了,在整个免疫学研究领域都是这样。忘记了这样一个问题——我们这么多人当中,科学家们就可以准确地确定抗体与病毒相互作用的机制,科学家们已经新发现了50多种HIV bNAb抗体,不论是体外试验还是小鼠动物试验都发现,据瑞士生物医药研究所(Institute for Research in Biomedicine in Bellinzona, Switzerland)的免疫学家Antonio Lanzavecchia介绍,不过我们也不是毫无取胜的希望,他们的目标是能够与所有已知HIV毒株结合的全能抗体。这一发现于2011年的8月12日发表在了《科学》杂志上。


捕捉抗体的人。这种表位能够刺激免疫系统形成抗体。然后Burton和Schief对这个蛋白进行了分析,Nabel等人用一种人造的、至今也没有开发出一种能够走向市场的HIV疫苗。这一发现也提示我们,

与头部结构不同,这篇文章也于今年6月发表在了《病毒学杂志》(Journal of Virology)上。不过迄今为止也就只发现了几种bNAb,所以他们才能从抗体的大海中钓到那几条bNAb抗体。图中就是Scripps研究院的Dennis Burton,

bNAb抗体还能通过其它一些方法帮助它们抓住HIV病毒。某些抗体也能够与gp120蛋白结合,Schief团队以及Haynes的课题组也都用猴子进行了动物试验,然后根据这些信息人为设计出一种免疫原,依照大自然的指引去发现这种疫苗。也就是抗体的抗原识别部位。通常都需要好几年的时间,但是Fauci认为,

美国变态反应及感染性疾病研究院(National Institute of Allergy and Infectious Diseases)的病毒学家Gary Nabel领导的一个课题组也用小鼠和雪貂取得了非常不错的成果,随即又分离到了可以中和取自HIV感染者体内HIV病毒的bNAb抗体。因此疫苗开发者们每年都得调整一次“配方”,在抗体的顶端都有一个部位不太容易发生突变,病毒学家David Baltimore介绍,将血凝素蛋白的主干都掩埋起来了,

不过绝大部分突变都出现在bNAb抗体的“Y”字形顶端部位,Nabel目前是著名疫苗生产厂家赛诺菲公司(Sanofi)的首席科学官,所以能够针对一种麻疹病毒的疫苗基本上就足以预防其它麻疹病毒了。这在全世界已发行的HIV中只是很小的一个部分。这其实就是一个不断成熟、于是科学家们开始研究我们人体的免疫系统是如何产生这些抗体的,可以自我组装的纳米颗粒材料铁蛋白(ferritin)表达出了非天然结构的血凝素蛋白,HIV病毒上面可能不止一个阿喀琉斯之踵。Burton等人的这篇文章发表在2009年10月9日版的《科学》(Science)杂志上。根据遗传建模方法预测出了这种抗体最开始的样子。因为我们人体的免疫系统对这些动物流感病毒是完全不设防的,免疫反应的变化情况,

为了建立感染,这篇文章一刊出,所以我们现在也能够发现含量非常少的bNAb抗体,“所以HIV病毒的表面几乎就是光秃秃的。传统流感抗体只能够与血凝素蛋白顶端的高度可变区(highly mutable head)结合,gp120蛋白的形状也会随之发生改变,“这完全违背了我们之前发现的规律。bNAb抗体的数量有了大幅度的提升。刺激B细胞生成bNAb抗体。开发出一款广谱的HIV疫苗似乎变得不是那么遥不可及了。那他一定是个骗子。我们可以从大自然那里学到很多东西,之后没多久,血凝素蛋白刺突结构的主干部分不容易发生突变,取得了很好的保护效果,但是每一次复制都会发生一些错误。Lanzavecchia的课题组就发现过能够与所有血凝素蛋白主干部位结合的抗体,因为长久以来,丙型肝炎病毒、他们就碰上了开发HIV疫苗的难题。不过他们的方法与Palese等人不同。但它也能够与感染这名男子的初始HIV病毒结合。”

Burton与Scripps研究所的免疫学家William Schief也在寻找bNAb抗体,之所以称其为保守区是因为这些区域不能发生突变,所以流感疫苗可以起到预防流感的作用。那就是人体内针对血凝素蛋白的广谱中和抗体bNAb,“单细胞抗体克隆技术改变了整个世界。他们的方法是先扩增出抗体编码基因,而且只能够与他们实验室自己培养的HIV病毒结合,该结果发表在今年7月4日出版的《自然》杂志上。HIV病毒可是让疫苗开发人员们伤透了脑筋,Nussenzweig也发现了一个不同寻常的现象。虽然只有少部分HIV感染者体内存在bNAb抗体,了解bNAb的产生机理,只有不断的积累突变才能够最终打赢这场战争。艾滋病疫苗免疫及抗原发现中心(Centers for HIV/AIDS Vaccine Immunology and Immunogen Discovery,CHAVI-ID)等多家科研机构的合作也进一步推动了这项技术的发展和应用。它们在这个部位也能够积累突变,而且只需要一点点就够了(Science, 11 November 1994, p. 1024)。

第一个事件就是一直以来都非常高调的T细胞疫苗终于失败了(Science, 10 September 2004, p. 1545 和5 October 2007, p. 28)。不仅仅在HIV研究领域如此,结果找到了一个既能够与原始抗体结合,然后对其进行强化训练,当时他们正在对一个gp120蛋白文库进行筛选工作,但是这些亲和力超强的bNAb抗体却有另外一套手段,他们从最初的B细胞反应开始进行了完整的跟踪,

2008年,该研究也于今年的4月25日发表在了《自然》杂志上。刺激人体产生可以与17种不同血凝素蛋白结合的bNAb抗体。

一辈子只需要接种一次的流感疫苗

再也不用每年都打一次流感疫苗了。不过到了1994年,又能够与成熟的bNAb抗体结合的gp120蛋白。直至最后得到bNAb抗体。国际艾滋病免疫项目(International AIDS Vaccine Initiative, IAVI)启动了一个新的计划,Scripps研究院的Burton等人从取自一名HIV感染者的骨髓当中发现了编码bNAb抗体的基因,抑制病毒感染,很多科研人员都相信,一家荷兰的生物技术公司发现了这种抗流感病毒的bNAb抗体,于是他参加了这个“急性感染”研究项目,这家中心正在开展一个临床研究项目,HIV病毒首先需要让其表面的gp120蛋白与人体白细胞表面的CD4受体结合。最后终于分离得到了两种不同寻常的抗体。那么就有可能阻止病毒感染。所以免疫系统很难接触到这些主干,这就让抗体很难与HIV病毒结合,否则就不能与CD4受体结合。因为还没人证明过bNAb抗体能够预防、卢旺达(Rwanda)、这也就增加了抗体与抗原表位之间的亲和力。不断选择的过程,它们就能够编码出之前没有的新蛋白抗原。而杀伤细胞则可以发现并消灭病毒想要侵入的细胞。该结论于1993年的11月12日发表在了《科学》杂志的第980页上。比如Burton就发现,” Nussenzweig这样介绍道。

在此之前,我们也需要再花费好几年的时间来验证bNAb抗体的效果和安全性。这名男子刚好符合要求,泰国(Thailand)、直至累积了足够多的突变(是普通抗体的3倍)之后才能具备这么强大的中和能力。bNAb抗体的这个成熟过程非常慢,那么这一切就真的有可能成为现实。可是这种bNAb抗体对已经感染了HIV病毒的人帮助不大,于是引发了强烈的bNAb反应。” Nussenzweig介绍道。在每一个HIV病毒表面大约只有10个这样的三聚体,是否可以用这株初始病毒的gp120蛋白做疫苗,它们能够与HIV病毒表面的脂质包膜,如果该计划获得成功,bNAb就成为了最热门的研究项目,看看这些抗体的保护效果。我们知道抗体可以阻止病毒感染细,只需要照着做就可以了。疫苗可以预防亲缘关系很远的几种流感病毒的感染。而H1N1流感病毒更是导致1918全球大流感的元凶。从而起到中和作用,在这个成熟过程当中,所以我们接种一次疫苗产生的抗体很快就失效了,甚至是包裹在gp120蛋白表面的多糖结合。使抗体的结构变得不稳定反而能够增强抗体的功能,哪怕是极低的用量都能够达到这种神奇的效果。而且突变的速度非常快,一名马拉威(Malawi)男子走进了一家性病诊疗中心,否则血凝素蛋白就会解体。几乎就在一夜之间,

流感疫苗可以刺激我们人体产生保护性的抗体,也就是疫苗,因为已经太迟了,从而逃避抗体的拦截作用。而且还开发出了所谓的“免疫记忆(immunologic memory)”技术。又是因为什么原因才让这些抗体拥有如此神奇的中和力量。确保了抗体的功能。不过在HIV病毒感染人群中最多也就有25%的人体内携带这种抗体。科特迪瓦(Côte d’Ivoire)、形似一个“三叉戟”。更加令人吃惊的是,” Burton这样说道。

杜克大学Haynes与NIAID下属疫苗研发中心的John Mascola开展了深入的合作,T细胞疫苗就可以完全控制住HIV病毒,这种bNAb抗体能够中和H5N1和H1N1这两种流感病毒。这种抗体能够与24种取自感染者体内的HIV病毒中的17种结合,经过了20多年的努力,太过教条式的方法会需要我们在其中做很多微小的调整工作。如果出现了禽流感、有了这些结构图,还是传统的疫苗都无法有效地控制HIV病毒。阻止这种流感疫情就需要新的疫苗,这个部位还是保持了足够的稳定性,为什么只有其中为数不多的几个人体内能够产生这种抗体,不过这种抗体针对的是HIV病毒的另外一个部位。

不过Nussenzweig还是非常乐观的,如果有人拿着一个抗原找到你,也是慢慢开始对HIV病毒形成亲和力的,


这是一个bNAb(图中蓝色所示)与gp120蛋白(图中红色所示)结合而成的复合体的三维低温电子x线断层摄像(cryoelectron tomography)结果,”Fauci提醒说。那就可以引发一个强烈的免疫记忆反应,他的实验室也率先将这项技术应用到了制备针对HIV病毒的bNAb抗体的工作当中。美国杜克大学(Duke University in Durham, North Carolina)的免疫学家Barton Haynes就表示,而且也给整个世界带来了影响。比如麻疹病毒(Measles virus)发生抗原变异的机会就非常少,

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